本作は、SF文学の巨匠・筒井康隆が1965年に発表した短編『時をかける少女 (小説)』を原作としている。しかし、時をかける少女 (2006年の映画)は、原作の直接的なアニメ化ではない。物語の舞台を2000年代の東京に移し、原作の主人公であった芳山和子を「魔女おばさん」として配役した正統続編であり、見事な変奏曲なのだ。
原作が静謐でどこかミステリアスな雰囲気を纏った青春SFであるのに対し、アニメ版は躍動感にあふれるストーリーへと進化を遂げた。タイムトラベルという古典的なガジェットを使いながらも、本質的に描かれているのは高校生たちの等身大の葛藤と選択である。時代が変わっても色褪せないノスタルジーと、現代的な疾走感の見事な融合がここにある。
