魅力の多い小金井キャンパスですが、進路選択において後悔を避けるためには、いくつかの構造的盲点やネット上の誤解を正しく認識しておく必要があります。
第一の誤解は、「東京農業大学（東農大）との混同」です。親戚や一般的な知人に大学名を伝えた際、「あの大根踊りの大学ね」「世田谷にある農業の大学？」と悪気なく返される事態は、農工大生が経験する通過儀礼のようなものです。国立の「東京農工大学」と私立の「東京農業大学」は歴史的にも組織的にも全く異なる大学です。小金井キャンパスで学ぶのは先端工学であり、この知名度ギャップにプライドを傷つけられるような繊細な受験生は、事前にメンタル面での心構えが必要です。
第二の盲点は、理系特有のハードな拘束時間とキャンパスのコンパクトさです。文系学部が存在しない単科大学的な環境であるため、全学的な学園祭（11月の農工祭など）を除けば、日常的なキャンパスの雰囲気は「研究機関」そのものです。広大なグラウンドや豪華なラウンジを期待すると、手狭で機能本位な建物群に拍子抜けする可能性があります。また、3年次後期から4年次にかけての実験・輪講・研究室活動は週5日朝から夕方（場合によっては夜間）まで拘束されることが珍しくなく、長期インターンシップや頻繁なアルバイトとの両立は周到なタイムマネジメントが要求されます。
