利用者の多くが気にするのが「予約なしでも当日に港へ行けば乗れるのか」という点です。結論から言えば、九四フェリーは予約なしの当日枠が全便に確保されているため、空きがあればそのまま乗船券を購入して乗ることができます。
しかし、ここには旅行計画を大きく狂わせる落とし穴が存在します。平日の日中であれば当日枠でもスムーズに乗船できるケースが多いものの、ゴールデンウィーク・お盆・年末年始・3連休などのピーク時には国道九四フェリーの混雑状況が一気に激化します。当日枠の車列がターミナル外まで伸び、希望の便に乗れず「1便待ち」「2〜3便待ち（約2〜3時間の足止め）」を余儀なくされる事態が頻発します。
特に佐田岬半島を貫く三崎港側は周辺に時間を潰せる商業施設が限られるため、長時間の乗船待ちは大きなタイムロスとなります。週末や連休に利用する場合は、飛び込み乗船を避け、事前にネット予約枠を確保しておくことが旅を成功させる鉄則です。
