武蔵村山病院は、大型ショッピングモール「イオンモールむさし村山」の至近に位置しており、車および公共交通機関の双方でアクセスしやすい立地にあります。
公共交通機関を利用する場合、西武拝島線・多摩都市モノレールの「玉川上水駅」や、JR「立川駅」、西武新宿線「東大和市駅」からの路線バス（立川バス・西武バス・都営バス）が多数運行されており、「武蔵村山病院」バス停下車すぐでアクセスできます。さらに、病院が運行する無料巡回送迎バスが玉川上水駅方面などを結んでおり、通院患者や付き添いの方の足として重宝されています。送迎バスの時刻表や乗り場は平日と土曜でダイヤが異なるため、乗車前に最新スケジュールを把握しておくと無駄がありません。
車でのアクセスに関しては、敷地内に大規模な自走式駐車場を完備しています。武蔵村山病院の駐車場料金は、外来受診者や入退院の付き添いであれば院内設置の認証機に駐車券を通すことで、一定時間無料または大幅な割引料金（数時間で100円〜数百円程度）で利用可能です。一般利用（お見舞いや近隣利用）の場合は通常料金が加算されるため、受診時は会計窓口や精算機周辺での割引処理を忘れないよう注意してください。
