酸ヶ湯温泉旅館の代名詞とも言えるのが、160畳の巨大木造空間に白濁した湯煙が立ち込めるヒバ千人風呂です。釘を一本も使わずに建てられた大楼閣の内部には、「熱湯（ねつゆ）」「四ツ滝」「冷え湯」「鹿の湯」など異なる源泉と温度を持つ浴槽が点在し、圧倒的な湯量を誇ります。しかし、現代において最も多くの関心と緊張を集めるのが「混浴」という利用形態です。
現在、浴場内には明確な混浴ルールが敷かれています。脱衣所は男女で完全に分かれており、浴場内の中央付近には木の衝立（ついたて）が設置され、男性エリアと女性エリアの境界線が視覚的に区切られています。さらに、女性向けには身体を覆う厚手の「湯浴み着」（売店で購入または湯着レンタル可能）の着用が公式に認められており、入浴用着を着用したまま湯船に浸かることが可能です。白濁した強い酸性の湯膜が視線を遮るため、湯に入ってしまえば外から身体が見える心配はほとんどありません。
それでも混浴に抵抗がある女性のために、毎日決まった時間帯に女性専用時間が設けられています。設定時間は午前8時〜9時、および午後8時〜9時の1日2回。この各1時間は男性の立ち入りが完全に禁止され、広大な木造空間を女性だけで心ゆくまで堪能できます。「混浴の時間帯は緊張して落ち着かなかったが、女性専用時間なら湯気の彼方まで広がる空間美を素肌で存分に味わえた」という宿泊者の証言が示す通り、この時間枠を狙って旅程を組む女性客が大多数を占めます。
なお、ヒバ千人風呂の浴槽内および洗い場では、石鹸やシャンプーの使用が禁止されています。身体や髪をしっかり洗いたい利用者のために、館内には男女別の小浴場玉の湯が用意されています。泉質は千人風呂と微妙に異なりながらも良質な強酸性泉で、こちらにはカランやアメニティが完備されているため、「まず玉の湯で身を清めてから千人風呂へ向かう」というのが現場の定石です。
