一般的な美術館とベネッセハウスミュージアムを分かつ決定的な違いは、「展示空間そのものに滞在し、生活とアートの境界線が溶け合う感覚を味わえる点」にあります。館内には世界屈指の現代アートが常設展示されているだけでなく、海を見渡す客室、レストラン、カフェがシームレスにつながっています。
朝の澄んだ光、夕暮れのグラデーション、夜の静寂、そして波の音。時間の経過とともに刻一刻と表情を変える瀬戸内の大自然が、作品の一部として計算し尽くされています。ただ壁に掛けられた絵画を眺めるのではなく、自分自身の身体感覚全体でアートと対峙する体験こそが、この場所が世界最高峰のアートリゾートと称賛される理由です。
屋外の海岸線や森の中にもサイトスペシフィック・ワーク（その場所のために制作された作品）が点在しており、館内にとどまらず直島の豊かな自然環境すべてが展示室として機能しています。
