大手進学模試（Vもぎ・Wもぎ）の最新データにおいて、都立新宿高校の偏差値は68〜69を安定して記録しています。都立最上位の「進学指導重点校（日比谷・戸山・青山など）」に迫る学力層が集結しており、実質的な難易度は重点校の併願・選択肢としても完全に定着しました。
東京都教育委員会から指定を受ける「進学指導特別推進校」の中でも突出した進学成果を上げており、同じ推進校グループの小山台高校や駒場高校などを牽引する存在です。駿台模試などの難関向け模試でも合格目標ラインは高く設定されており、基礎基本の完全定着はもちろん、応用力や論理的思考力がシビアに問われるトップ校としての地位を確立しています。
