グループの歴史を語るうえで避けて通れないのが、モーニング娘。脱退理由や歴代メンバーの卒業真相をめぐる議論です。結成初期から現在に至るまで、メンバーの離脱時には常にネット掲示板やSNSで様々な憶測が飛び交ってきました。
黎明期における福田明日香の「学業専念」による脱退や、市井紗耶香の転身劇、後藤真希のソロ独立など、初期の卒業劇はグループの急激な肥大化に伴う本人の精神的疲弊や進路変更が主因でした。当事者が後にテレビ特番のインタビューや自著・手記で語った生の告白を検証すると、「10代の少女が受け止めきれないほどの過密スケジュールと世間の狂騒」が現実の引き金であったことが浮き彫りになっています。
また、矢口真里や藤本美貴のように、当時の芸能スキャンダル報道を契機として「グループの規律とブランドを守るため」に自ら身を引いたケースも存在します。これらはネット上で「事務所による強制解雇」と噂されたこともありましたが、実際にはグループへのダメージを最小限に抑えるための自発的なリーダー辞任・脱退交渉であったことが後の関係者証言から裏付けられています。
対照的に、近年ハロー!プロジェクト公式発表として出される卒業理由は極めて健全かつ構造的です。近年のモーニング娘。では、20代半ばを迎えたメンバーが「次の個人の夢（演技、ソロ歌手、制作、海外留学など）」に向けて十分な準備期間を取り、円満にセレモニーを開催するシステムが定着しました。卒業真相とネットの反応を比較しても、かつてのような炎上や不協和音の告発は影を潜め、ファンも門出を祝福する成熟したカルチャーへとシフトしています。
