事件が発生したのは、日常の些細な隙間時間だった。警察の発表および家族の説明によれば、児童が最後に見かけられたのは放課後の午後4時15分ごろ。近所の公園で友人たちと別れた後、自宅方向へ向かって歩いていた姿が防犯カメラに記録されている。しかし、自宅に到着するはずの午後4時30分までのわずか数百メートルの区間で、その足取りは忽然と途絶えた。
捜査本部が特に注視しているのが、午後4時20分から5時00分までの「空白の40分間」だ。この時間帯、父親は勤務先からの帰宅途中だったと主張しているが、カーナビの走行履歴やスマートフォンの位置情報ログには一部不自然なデータの欠落が存在することが判明。この事実がメディアやネット上で漏れ伝わったことが、初期の疑問符を生み出す引き金となった。