築地魚河岸を利用する上で、最も注意しなければならないのが営業時間と一般開放時間の厳格な区分です。施設自体の開館は早朝5時ですが、午前5:00〜午前9:00はプロの飲食店関係者や仕入れ業者専用の時間帯に設定されています。
この時間帯、1階の仲卸エリアは台車やフォークリフトが行き交い、真剣勝負の買い付けが行われています。一般の観光客や個人客が商品を購入できるのは午前9:00以降となっており、警備員や店舗スタッフによるルール遵守の案内が徹底されています。午前8時台に訪れても1階の買い物はできないため、訪問スケジュールを組む際は「9時現着」を目安にするのが賢明です。
さらに見落としがちなのが定休日（休市日）の存在です。築地魚河岸の休館日は基本的に日曜・祝日および水曜日（原則として豊洲市場の休市カレンダーに連動）となっています。場外市場の一部の飲食店は水曜日に営業しているケースもありますが、築地魚河岸の仲卸フロアは閉鎖されるため、事前の中央区公式情報や場外市場カレンダーの確認が欠かせません。
また、昨今のインバウンド急増に伴い、築地エリア全体で「食べ歩き（歩行食）の禁止マナー」が強化されています。購入した刺身や惣菜を通路や路上で歩きながら食べる行為は接触事故や衛生面から禁止されており、購入店舗のイートインスペースまたは小田原橋棟3階のフリースペースを利用することが義務付けられています。
