JRの華やかな特急列車だけでなく、熊本の魅力は地域に根ざした個性派私鉄路線にもあふれている。熊本電気鉄道株式会社(熊本電鉄)では、東京メトロなどから譲り受けたレトロな車両や人気キャラクターのラッピング電車が街中を走り、鉄道ファンならずとも思わずカメラを向けたくなるノスタルジーを感じさせる。
また、熊本地震からの完全復興を果たした南阿蘇鉄道株式会社のトロッコ列車「ゆうすげ号」も外せない名ルートだ。窓のない開放感抜群の車両から肌で感じる阿蘇の澄んだ風、深緑の渓谷にかかる白川第一橋梁からのスリリングな絶景は息を呑むほどの美しさ。沿線の地域住民が笑顔で手を振ってくれる温かいおもてなしも、旅人の心を深く満たしてくれる。