木更津総合高等学校の受験を検討するにあたり、まず把握しておくべきがコース別の難易度と偏差値の幅広さです。同校は単一の学力基準ではなく、目指す進路や適性に応じた複数のコースを設置しています。
最上位に位置する「特別進学コース（特進）」の偏差値は56〜58前後となっており、千葉県内の私立中堅上位クラスの学力が求められます。放課後講習や長期休暇中のセミナーなど手厚い受験指導が行われ、一般選抜で難関大学を目指す生徒が集結しています。
一方、大学・短大・専門学校への進学を広くカバーする「進学コース」の偏差値は48〜51前後、商業・情報系や就職・実務教育を含む「総合コース」などは42〜46前後が目安となります。入試倍率はおおむね1.0〜1.2倍程度で推移しており、推薦入試（単願・併願）を利用して内申基準を満たしていれば、極端な高倍率で不合格になるリスクは比較的低めです。ただし、特進コースの一般入試や特待生選考では確実な当日の得点力が求められます。
