2人の間には、これまで2人の子供が誕生しています。公式発表資料によると、第1子は2016年10月、第2子は2018年末から2019年春にかけて誕生が報告されました。2026年現在の年齢は、第1子が9〜10歳（小学校高学年）、第2子が7歳前後（小学校低学年）となります。
ファンの間で関心が高い子供の性別や名前について、夫妻は一貫して完全非公開のスタンスを貫いています。これは欧米のトップアーティストや映画監督らと交流が深い菊地凛子の「子供を一人の独立した人格として尊重し、メディアの消費対象から守る」という強いポリシーによるものです。
インタビュー記事や現場スタッフの証言から浮かび上がるのは、徹底した「ワンオペ育児の排除」と「完全シフト制の家庭運営」です。菊地凛子が海外ドラマや映画の長期ロケに入る際は染谷将太が家庭の主導権を握り、逆に染谷将太が大河ドラマや舞台に集中する際は菊地凛子が現場をセーブして子供たちと過ごすという、フレキシブルな家庭内パートナーシップが確立されています。
