海外メディアから「日本版CIA」と称されることもあるが、実際の組織構造は米国の強大な中央情報局とは大きく異なる。独自の国外法執行権や大規模な特殊作戦部隊を持つわけではない。実体は、国内外の膨大な情報を集積・分析し、首相をはじめとする政権中枢に精緻な情勢判断を提供する戦略的ブレーン集団である。
機密情報の収集プロセスは多岐にわたる。外交ルート、公開情報、さらには通信傍受や衛星画像データ分析まで、ありとあらゆる手法が駆使されている。その組織の核心を担う人材の多くは、警察庁からの出向組だ。犯罪捜査や治安維持で培われた鋭い洞察力が、国家安全保障の現場に直結している。