他社ECと一線を画す最大のストロングポイントが、ヨドバシ・ドット・コム 送料無料の原則です。合計金額の縛りがなく、消しゴム1個、ボタン電池1パックといった数十円〜数百円の少額注文であっても、日本全国（一部離島除く）へ配送料無料で届けられます。
この驚異的な物流を支えているのが、東京都内23区全域をはじめ主要都市部を網羅する自社配送網「ヨドバシエクストリームサービス便」です。ヨドバシ エクストリーム便 配達時間の柔軟性は群を抜いており、朝方に注文した商品がその日の夕方には手元に届くケースも珍しくありません。配達員が自社専属スタッフであるため、「置き配」の指定場所への配慮や再配達のスムーズさに関しても、他社配送委託業者と比べてトラブルが極めて少ないと評価されています。
