これまでの日本人の起源論は、縄文人と弥生人の混血を説く「二重構造モデル」が主流でした。しかし、日本人のルーツと遺伝子研究最新データにより、現在はさらに一歩進んだ「3重構造モデル」が学界で大きな支持を集めています。
理化学研究所や金沢大学などの最新研究では、現代の日本人は「縄文人」「弥生人（北東アジア系）」に加え、古墳時代前後に渡来した「古墳人（東アジア系・漢民族系）」の3つの祖先集団からゲノムを受け継いでいることが明らかになりました。
この最新モデルにおいて、本州・四国・九州の本土集団は弥生人および古墳人の遺伝的影響を強く受けて平坦な顔立ちへとシフトした一方、沖縄の人々は古墳人の渡来による影響をほとんど受けず、縄文人のゲノムを極めて純度の高い状態で保持し続けました。つまり、沖縄の人が「顔が濃い」のではなく、歴史の過程で本土の人々の顔立ちが薄くなっていったというのが、現代科学が導き出した驚くべき結論です。
