ペットとして流通している代表的なドジョウには、それぞれ個性や特徴があります。
マドジョウ（真泥鰌）は、日本の河川に広く生息する最もポピュラーな種です。適正水温は10℃〜25℃と幅広く、丈夫で環境適応力に優れていますが、20cm近くまで大きく育つため広めのスペースが必要です。
シマドジョウは、体側にある美しい斑点模様が特徴で、最大でも10〜12cm程度と小型です。清流を好むため、やや高水温に弱く綺麗な水を好みます。適正水温は15℃〜23℃前後をキープし、夏場の水温上昇には注意を払いましょう。
黄色やオレンジ色の鮮やかな体色を持つヒドジョウ（緋泥鰌）は、マドジョウの黄変種（アルビノ・白変種系統）です。水槽内で非常に目立ち、人懐っこい性格からアクアリウム初心者に最もおすすめできる品種です。飼育条件はマドジョウに準じ、温和で混泳にも向いています。
