熊工を語る上で、文武両道の「武」を体現する部活動の金字塔を避けて通ることはできません。とりわけ硬式野球部と吹奏楽部の全国的な存在感は、公立校の枠を完全に超越しています。
硬式野球部は、甲子園春夏通算40回以上の出場実績を誇る全国屈指の名門です。第78回全国高校野球選手権（1996年夏）の決勝戦、奇跡のバックホームとして高校野球史に永遠に刻まれる松山商業との死闘は、いまなお高校野球ファンの記憶に鮮烈に残っています。プロ野球界に送り込んだ逸材の顔ぶれも規格外です。
- 川上哲治：「打撃の神様」と称され、読売ジャイアンツのV9時代を築いた不世出のレジェンド
- 前田智徳：広島東洋カープの孤高の天才打者として通算2119安打を達成
- 緒方耕一：読売ジャイアンツで盗塁王に輝き、韋駄天としてファンを魅了
- 荒木雅博：中日ドラゴンズの黄金期を支えた「アライバ」コンビの名二塁手、通算2000安打達成者
- 伊東勤：西武ライオンズの黄金期を捕手として統率し、名将としても手腕を発揮
こうした球史に残るOBたちの存在が、今なおグラウンドに立つ現役球児の強いメンタリティを育んでいます。
一方の文化系部活動では、熊本工業高校吹奏楽部が全国の吹奏楽界でその名をとどろかせています。全日本吹奏楽コンクールや全日本マーチングコンテストにおいて幾度となく全国大会金賞を獲得。躍動感あふれるサウンドと一糸乱れぬマーチングフォーメーションは、工業高校男子主体の力強いパフォーマンスとして全国に熱狂的なファンを持ちます。「運動部も文化部も、やるからには全国の頂点を目指す」という気概が、学校全体の空気感を支配しています。
