『Dr.コトー診療所』のリアリズムを担保していたのが、日本最西端に位置する沖縄県与那国島での過酷な長期ロケでした。CG全盛の時代にあって、荒れ狂う東シナ海の波や吹き荒れる台風の映像は、すべて現地でキャスト・スタッフが体を張って撮影したものです。
2026年現在も、与那国島の比川集落に建設された「志木那島診療所」のオープンセットは保存・一般公開されており、聖地巡礼に訪れるファンの足が途絶えることはありません。入場料は施設の維持管理費や地域振興に充てられており、ドラマが島の観光資源として持続的に貢献しています。
SNSやレビューサイトに寄せられるファンの声を見ても、「診療所の待合室に立つだけで、コトー先生と島民たちの体温が伝わってくる」「20年以上前の建物がそのまま残されていることに島の深い愛を感じる」といった感動の書き込みが多数を占めています。